认主独一与三位一体论是相斥的。
认主独一是伊斯兰信仰的根基，三位一体教义是基督教的信仰根基。
认主独一宣示的是造物主：独一，无终与至上，无敌无偶；没有任何被造物与其相似，既不生物，也非物所生的属性。而三位一体教义正好与之相反。
《古兰经》视角下的认主独一信仰是所有圣人共同的信仰。 三位一体的首创者是在玛利亚之子艾撒圣人之后大约150年后生活在雅典的一位叫阿特纳高来斯的神父。后来一个叫特尔提拉努斯（166—220）的大主教参考了多神信仰使三位一体信仰形成一种信仰体系，成为基督教的基本教义。
在认主独一信仰里穆斯林不会去祈求安拉之外的任何人，包括穆罕默德圣人；而三位一体信仰里基督教徒可以祈求玛利亚之子艾撒。穆罕默德圣人在临终前嘱咐唯一的后代法图麦说“我的女儿法图麦啊，你要以你自己的善行来在安拉面前求得解脱，指安拉发誓在后世我对你对状况是无能为力的。”
在认主独一信仰里对于穆斯林来说穆罕默德圣人的躯体并不是神圣的，而在三位一体信仰玛利亚之子艾撒的躯体是神圣的。
在认主独一信仰里穆斯林不崇拜穆罕默德圣人，崇拜穆罕默德圣人与崇拜偶像是同一回事；而三位一体信仰里基督教徒如果不崇拜玛利亚之子艾撒圣人，甚至无法成为基督教徒。
